Molekylära mekanismer för transkriptionell omprogrammering vid hälsa och sjukdom

Transkription – processen för RNA-syntes över hela genomet – definierar celltyper och cellulära reaktioner. Reglerande steg i transkriptionen har undersökts ingående vid promotorer för mRNA-kodande gener, vilket har gett oss vår nuvarande förståelse av de ordnade interaktionerna mellan DNA-element, transkriptionsfaktorer och RNA-polymeras II.

Emellertid utgör mRNA endast 3 procent av det totala RNA:t i en cell, och dynamiken och mekanismerna som styr RNA-polymeraser I, II och III under differentiering, sjukdomar och cellstress är fortfarande dåligt förstådda. Dessutom är det fortfarande i stort sett outforskat hur transkriptionen koordineras mellan olika kompartiment, såsom mitokondrier och kärnor – eller genom hos patogener och värdar – och detta kräver nya verktyg.

Denna föreläsning beskriver hur Anniina Vihervaaras forskning bidrar till metodutveckling, vilket gör det möjligt att övervaka processen för RNA-syntes av alla RNA-polymeraser med nukleotidupplösning i hela genomet. Hon kommer vidare att beskriva hur forskarna använder verktyg för hela genomet för att belysa molekylära mekanismer som koordinerar transkription vid akut stress, under differentiering och vid olika sjukdomar, såsom cancer, neurodegeneration och infektioner.