Unraveling the Molecular Mechanisms of Complex Diseases Using Systems Biology Approach
Tid: On 2024-10-30 kl 13.00
Plats: Kollegiesalen, Brinellvägen 8, Stockholm
Videolänk: https://kth-se.zoom.us/j/69004831025
Språk: Engelska
Ämnesområde: Bioteknologi
Respondent: Meng Yuan , Science for Life Laboratory, SciLifeLab, Systembiologi
Opponent: Senior Lecturer Niloufar Safinia, King’s College London University,
Handledare: Universitetslektor Adil Mardinoglu, Science for Life Laboratory, SciLifeLab, Systembiologi; Docent Cheng Zhang, Science for Life Laboratory, SciLifeLab, Systembiologi
QC 2024-10-01
Abstract
I samband med ökande globala hälsoutmaningar har den mekanistiska
undersökningen och behandlingen av komplexa sjukdomar, inklusive cancer och
leversjukdomar, blivit ett viktigt fokus inom vetenskaplig forskning. En djupgående
förståelse av grundläggande biologiska processer är avgörande för utvecklingen av
verktyg som hjälper till att diagnostisera, övervaka och behandla mänskliga
sjukdomar. Denna doktorsavhandling undersöker de molekylära mekanismerna
bakom komplexa mänskliga sjukdomar, med betoning på att upptäcka nya
terapeutiska mål och substanser genom systembiologiska tillvägagångssätt. Genom
att utnyttja storskaliga transkriptomiska data syftar detta arbete till att avslöja nya
insikter i sjukdomsbiologin som kan driva läkemedelsompositionering och
precisionsmedicin. Avhandlingen integrerar olika beräkningsstrategier och
biologiska ramverk för att koppla genuttrycksmönster till sjukdomsutveckling och
terapeutiska möjligheter, med fokus främst på cancer och metabola sjukdomar.
Studierna som samlats i denna avhandling bidrar avsevärt till förståelsen av
mänsklig sjukdomsbiologi genom systematisk analys av genuttrycksprofiler och
tillämpning av nätverksbaserade metoder. Paper I introducerar Human Pathology
Atlas och ger en djupgående analys av prognostiska genuttrycksdrag i olika
cancertyper, vilket förbättrar vår förståelse av sambanden mellan genuttryck och
sjukdomsutfall. Paper II och Paper III använder genko-
expressionsnätverksanalys kombinerat med läkemedelsompositionering för att
identifiera lovande terapeutiska kandidater för hepatocellulärt karcinom och
pankreatiskt duktalt adenokarcinom. Dessa studier visar hur nätverksbaserade
metoder kan lokalisera viktiga molekylära mål och potentiella återanvändbara
läkemedel för olika cancerformer.
I Paper IV tillämpas ett nätverksbaserat tillvägagångssätt för att undersöka den
dysreglerade transkriptionella regleringen vid icke-alkoholisk fettlever (NAFLD).
Denna studie identifierar kritiska gener och vägar som är involverade i sjukdomens
utveckling och ger nya insikter i NAFLD patofysiologi. Slutligen presenterar Paper
V en omfattande översikt över den framväxande rollen för PKLR i leversjukdomar
och betonar dess koppling till metabola sjukdomar. Denna översikt diskuterar PKLR
potential som ett terapeutiskt mål och ger en grund för framtida studier inom
metabol sjukdomsforskning.
Sammanfattningsvis bidrar denna avhandling till området systembiologi genom att
integrera genuttryck och nätverksmetoder och erbjuda innovativa strategier för
terapeutisk utveckling och personanpassad medicin inom komplexa sjukdomar.